SAISON N°1
EPISODE 1
Michael Scofield, brillant ingénieur en génie civil, souffrant de trouble émotif, avec un QI exceptionnel, commet un braquage pour être incarcéré dans la même prison que son frère, condamné à mort pour le meurtre de Terrence Steadman, un homme d'affaire philanthrope et frère de la vice-présidente. Michael est convaincu de l'innocence de son frère, Lincoln Burrows et possède les plans de la prison qu'il a aidé à rénover tatoués sur le corps. Il est confiant dans un plan d'évasion qu'il a méticuleusement mis au point et dont il ajuste les pièces peu à peu. Scofield se fait passer pour diabétique dans le but d'avoir un accès quotidien à l'infirmerie qui serait le "maillon le plus fragile" dans la sécurité. Il y fait la rencontre de Sara Tancredi, médecin de la prison et fille du gouverneur. Une ex de Burrows, Lisa Rix, a la garde de leur fils L.J, qui se fait arrêter en possession de drogue. L'avocate de Scofield et ex-fiancée de Burrows, Veronica Donovan, se doute de ce que son client prépare.
EPISODE 2
Une émeute fermente dans la prison. Scofield doit récupérer une vis, élément clé de son plan, qui lui a été volé par un des gangs (les "bleachers"). Il doit aussi récupérer un certain médicament pour continuer de simuler son diabète qui lui donne accès à l'infirmerie, partie aussi de son plan d'évasion. Peu à peu, les événements s'accumulent contre lui. Dehors, Veronica son avocate enquête sur l'affaire de Burrows (le meurtre de Steadman) et visionne une cassette accablante. Au même moment les services secrets man½uvrent pour se débarrasser de tout ce qui peut empêcher l'exécution de Burrows et ne n'hésitent pas à recourir au meurtre; une menace pèse maintenant sur Véronica.
EPISODE 3
Veronica arrive à convaincre la jeune femme à tout lui raconter, mais les services secrets vont lui mettre la main dessus. En prison, Michael teste Sucre pour savoir s'il peut lui faire confiance ; le test est positif, mais Sucre refuse de participer à l'évasion et se fait transférer de cellule. Scofield a un nouveau coturne : Haywire, qui n'inspire pas confiance. Le plan est bloqué car Scofield ne peut pas creuser. Abruzzi lui a coupé deux orteils sans succès pour le faire parler à propos de Fibonacci, puis décide de coopérer et de l'aider dans son plan en échange des informations que Scofield devra lui livrer à temparticle. Sucre a des doutes sur la stabilité des sentiments de Maricruz.
EPISODE 4
Veronica devient l'avocate de Lincoln Burrows et cherche des appuis. Les agents du service secret sont après elle et découvrent que Scofield est dans la même prison que son frère. Ils le suspectent de man½uvrer contre eux. En prison, le plan de Scofield est bloqué par l'attitude de son nouveau voisin de cellule, le disjoncté. Un de ses tatouages est une anagramme d'une formule chimique cute poison qu'il va préparer en secret. Sucre apprend que Maricruz sort avec Hector.
EPISODE 5
Kellerman et Hale (les agents du Secret Service) man½uvrent pour faire transférer Scofield. Un premier chantage contre le directeur échoue, ils reviennent à la charge et cette fois font craquer le directeur. Avec son transfert certain, le plan de Scofield tombe à l'eau. Veronica a réussi à associer un avocat spécialiste en peine de mort, et ensemble ils découvrent que la bande vidéo est truquée. En prison, Scofield a terminé le trou dans sa cellule et peut aller et venir dans les recoins de la prison ; et il s'en sert pour découvrir lequel des trois chemins menant à la prison il doit choisir entre English, Percy et Fritz pour échapper à la police à l'issue de leur évasion, si elle réussit.
EPISODE 6[1/2]
Scofield et Sucre sont sans cesse dérangés par les tours de comptage des gardiens et ça les met en retard sur le creusement du tunnel. Les conspirateurs sentent que la situation leur échappe et obtiennent qu'un prisonnier soit chargé d'assassiner Burrows. Scofield sabote le système de ventilation, ce qui énerve les prisonniers, qui s'agitent. Veronica et son associé découvrent qu'un des éléments du dossier d'inculpation est bidon et la piste doit être remontée à Washington. Dans le bloc, la situation dégénère en une émeute qui gagne toute l'aile du bâtiment où un gardien est pris en otage. En même temps, les malades se révoltent dans l'infirmerie, mettant la docteur en grand danger. Dans la bagarre, T-Bag et le gardien otage entrent dans la cellule de Scofield et Sucre et découvrent le trou. T-Bag décide donc d'être de l'évasion et veut tuer le gardien pour éviter qu'il ne parle. Apercevant sur l'écran de contrôle Sara Tancredi en dangereuse posture, Scolfield part la sauver.
EPISODE 7[2/2]
Le groupe profite de l'émeute pour percer un mur épais, quelque part sous la prison, partie de leur plan d'évasion. Michael a repéré les points de faiblesse dessus grâce à son tatouage, et Sucre et lui le travaillent à tour de rôle avec une mèche monté sur un batteur. L'émeute fait rage, le gouverneur débarque sur la prison, et il apprend que sa fille est en danger. Scofield, Sucre et Abruzzi font tout pour garder le gardien vivant, mais Michael ne peut pas rester, car il veut sauver Sara. Il se faufile donc dans les vide-sanitaires et au-dessus des faux plafonds jusqu'à l'infirmerie où elle allait passer à la casserole. Il l'extrait de là, mais ils ne sont pas sauvés pour autant car ils doivent rejoindre une sortie. L'homme qui a été engagé pour tuer Burrows le fait tomber dans un piège.
EPISODE 8
Une pièce de stockage par où ils devaient passer pour s'évader a été convertie en local des gardiens, et le but de l'épisode est d'y entrer pour percer un passage d'accès aux canalisations enterrées. Le directeur et le capitaine se démènent pour trouver qui a tué Bob (le gardien otage) durant l'émeute. Plusieurs épisodes auparavant, la chef des conspirateurs avait donné l'ordre de tuer Veronica. Elle est encore menacée dans l'épisode précédent, cette fois-ci ils passent vraiment à l'action. Après avoir menacé Burrows, ils envoient aussi les nettoyeurs chez son fils LJ qui se retrouve, avec sa mère (l'ex de Burrows) et son copain, en très fâcheuse position.
EPISODE 9
Les partenaires d'Abruzzi à l'extérieur (Falzone) ne lui font plus confiance, ils ont désigné un autre prisonnier pour être chef du gang, ils lui ont retiré ses fonds, ce qui l'empêche de payer Bellick pour ses privilèges. Il doit retrouver ses moyens, sinon il perd la direction des P.I. et ils ne pourront plus percer la salle. Veronica et Nick se sont cachés dans une cabane isolée de tout, Kellerman et Hale les croient morts. LJ a les Secret Service à ses trousses : ils le traquent grâce à son GSM, et découvrent au passage que Veronica et Nick sont encore vivants, et où ils se cachent. Nous savons des épisodes précédents que c'est la Vice-présidente elle-même, la s½ur de Steadman, qui est derrière la conspiration. Dans l'épisode précédent, Kellerman et Hale lui ont menti en lui disant que LJ avait été arrêté, mais ils s'apprêtent à mettre la main sur les trois gênants maintenant.
EPISODE 10
Kellerman et Hale ayant manqué d'attraper LJ, Veronica et Nick, la vice-présidente (elle connaît leur mensonge et leurs échecs) leur envoie Quinn, un autre nettoyeur, qui leur donne une première leçon. Abruzzi a perdu la direction de son gang et du P.I., et il convainc Scofield que la seule solution est de donner Fibonacci, pour qu'il retrouve le support de Falzone ; mais Fibonacci n'est pas un ex-mafioso, mais un père de famille innocent, et Scofield a du mal à se résoudre à le sacrifier. Un autre prisonnier, C-Note, s'apprête à découvrir le plan d'évasion. Veronica enquête sur le côté financier de l'affaire autour de Steadman ; elle se connecte à internet depuis la cabane, et se fait repérer par Quinn.
EPISODE 11
Sa femme (superbe) vient visiter Scofield, à la surprise générale. Elle lui apporte en secret une carte de crédit, qui est en fait une carte magnétique camouflée. Scofield se faufile jusqu'aux casiers des effets personnels, où il récupère ce qu'il avait avec lui lors de l'arrestation, dont de l'équipement électronique. Mais sa montre est manquante et il en a besoin pour son plan. Il engage un prisonnier (l'Acrobate) pour la reprendre au gardien qui l'a volée, en échange de peut-être de son intégration à l'équipe des P.I.. Westmoreland, ayant soudain besoin de s'évader pour voir sa fille mourante, avoue à Scofield qu'il est D. B. Cooper, le prouve et demande à faire partie de l'évasion en échange d'une partie de son magot. Avec le nouveau venu (BI, de l'épisode précédent), cela fait sept (Scofield, Burrows, Sucre, Abruzzi, T-Bag, C-Notes, D. B. Cooper (sans compter le voleur de montre). Quinn a trouvé la cabane et prend le contrôle de la situation (Veronica et LJ ligotés, Nick blessé mortellement); il veut savoir ce qu'ils savent et qui d'autre sait quoi. Sara est jalouse en découvrant que Scofield est marié et lui dit que leur relation sera désormais purement professionnelle; Bellick enquête sur la femme de Scofield. L'évasion est prévue dans quatre jours.
EPISODE 12
Scofield vient à la conclusion qu'ils sont trop nombreux et les autres l'apprennent. La tension monte alors que chacun se demande qui va être écarté. T-Bag et C-Note sont les plus probables ; T-Bag confie le secret de l'évasion à son cousin James, en dehors, avec consigne de tout raconter au directeur si quelque-chose lui arrive. Abruzzi prend l'affaire en main en éliminant le cousin et en mettant au point l'élimination de T-Bag. Pourtant, le sentiment de culpabilité qui habite Abruzzi le pousse à épargner la vie de T-Bag. Celui-ci en profite pour le blesser gravement. L'équipe a à nouveau une dimension compatible avec le plan d'évasion. Véronica, LJ et Savrinn échappent à Quinn et l'abandonnent au fond du puit près de la cabane. Quinn n'est pas secouru par Kellerman et Hale qui l'abandonnent après s'être assuré qu'il n'a plus de ressource. LJ et véronica emmènent Savrinn blessé à l'hoptital. De là, LJ part assister à l'enterrement de sa mère sous la surveillance discrète de Hale. Ému par le chagrin de l'adolescent, il le laisse partir. Scofield parvient à résoudre son dernier problème de tunnel. Ils s'évadent ce soir.
EPISODE 13
Même jour. La tentative de meurtre sur T-Bag a échoué et c'est Abruzzi qui est dans un état critique. Il est évacué en hélicoptère médical d'urgence. En même temps, pour avoir dû retarder un garde pour protéger le tunnel, Burrows est envoyé en confinement. Les autres décident de s'évader quand même au grand désespoir de Scofield. Finalement, il trouve un moyen de maintenir le plan : C-Note s'occupe de trouver des complices pour l'évacuation, Scofield fait parvenir une pastille à Burrows qu'il avalera au moment opportun pour être envoyé à l'infirmerie, sur la route de l'évasion ou les autres vont le prendre. Hale retourne sa veste et décide de tout raconter à Veronica avant de s'enfuir. Veronica, sur la base de cette promesse va vers les médias et vers la cour pour dénoncer la conspiration. Le soir venu, elle va au rendez-vous avec Hale pour récupérer les preuves, tandis que l'évasion commence.
EPISODE 14
L'épisode reprend sur la même scène que l'épisode précédent. La tentative d'évasion a échoué, mais ils parviennent à regagner le bloc sans s'être fait prendre. Jour suivant : l'exécution est prévue pour le soir même (en fait le lendemain 00:01). Veronica et Nick obtiennent une audience et font leur demande de report, mais sans les preuves (Kellerman a descendu Hale, mais Veronica a eu le temps d'apprendre que Steadman est vivant). Scofield parvient à mettre en place deux autres plans de secours : d'une part il veut que Sara parle aux avocats de Burrows, qui parviendront à la convaincre de son innocence pour qu'elle en parte à son père le gouverneur. D'autre part, il parvient à saboter la chaise électrique, ce qui est sensé provoquer un sursis de trois semaines étant donné la complexité des procédures d'exécution. L'épisode se termine lorsque Burrows s'apprête à s'asseoir sur la chaise.
EPISODE 15
Suite de l'épisode sur la même scène. Au moment d'être exécuté, Burrows a une vision d'un homme (son père). Un coup de fil interrompt tout. C'est le juge qui a reçu deux documents qui, s'ils sont authentiques, prouvent l'innocence de Burrows, et il a fait surseoir l'exécution de deux semaines, en même temps qu'il fait exhumer le corps de Steadman. Scofield met en place un autre plan d'évasion, plus compliqué, qui passe par l'aile psychiatrique, et pour lequel il a besoin de se déguiser en gardien. Une de ses sorties tourne mal et il se retrouve grièvement brûlé.
EPISODE 16
Série de flashbacks recontant les histoires de Burrows, Sucre, T-Bag et C-Note jusqu'à leur arrestation. L'histoire de C-Note le lie au Koweit, celle de Sucre nous raconte sa rencontre avec Maricruz et les malfaisances du cousin Hector. On voit comment Scofield a imaginé son plan, et l'histoire de Sara.
EPISODE 17
Nous somme le lendemain du jour où l'exécution a été sursie. La brûlure de Scofield a détruit le plan de l'infirmerie, et il essaie désespérément de s'en rappeler. Les travaux dans la salle sont terminées et le chantier leur est retiré ; des artisans vont venir installer la moquette et découvrir le trou le lendemain. Sara ayant trouvé de l'étoffe d'un uniforme de gardien dans la brûlure, elle prévient Pope qui interroge Scofield. Scofield ne parle pas et est envoyé en isolement. Sucre est le seul à pouvoir boucher le tunel en y allant cette nuit là, mais il ne pourra pas l'utiliser pour le retour et il se fera probablement prendre. Nick et Veronica retrouvent le cadavre de Quinn et son téléphone. Nous aprenons qui est le mystérieux personnage qui a glissé les papiers au juge la veille. LJ décide d'aller se venger de Kellerman. Dans sa cellule d'isolement, Scofield craque.
EPISODE 18
Suite à sa crise en isolement, Scofield s'est fait envoyer en zone psychiatrique, non pas pour reconstruire le plan en explorant le sous-sol, mais en faisant parler Haywire qui avait fait des dessins de mémoire de ses tatouages. Mais Haywire est dans un piètre état à cause des médicaments qu'ils lui font avaler, et Scofield va déployer des trésors de patience. Pendant ce temps là, les gardiens mettent sa cellule aux enchères (elle est bien placée) ; Westmoreland, C-Note et T-Bag doivent trouver 500$ pour la racheter, ils se joignent aux parties de poker avec un plan. Kellerman a des problèmes pour rester dans le train à cause de l'attaque de LJ (sa couverture est en péril). LJ arrêté et inculpé de deux meurtres et une tentative de meurtre, tout le monde est surpris que les autorités aient accepté une requête de Burrows de lui rendre visite. Un autre prisonnier suspecte qu'un plan d'évasion est en cours et confronte le groupe.
EPISODE 19
Le convoi de Burrows se fait attaquer, Kellerman essaie de l'abattre, mais William intervient et s'enfuit avec Burrows. Scofield et Sucre sont sortis d'isolement. Tout le plan est en place, surtout avec Burrows libre, sauf qu'il leur faut la clé de l'infirmerie. Scofield essaie de se servir de Sara mais il n'y arrive pas, alors il demande l'aide de Niki, réticente. Abruzzi est de retour. Nick manigance quelque-chose, il travaille en sous-main pour un groupe tiers.
EPISODE 20
Scofield met Tweener dans la confidence, mais c'est une erreur, car celui-ci raconte tout à Bellick, qui découvre le trou. Westmoreland s'en rend compte à temps, assomme Bellick et le met dans le tunnel ligoté et baillonné. Burrows est à nouveau en isolement. N'ayant pas pu mettre la main sur la clé, Scofield décide de dire à Sara qu'il veut s'évader et qu'il faut qu'elle les aide . L'évasion est prévue pour ce soir ; et ça va être le moment pour Nick d'intervenir. Scofield menace Pope de son couteau et lui dévoile son plan, afin qu'il fasse tout pour faire sortir Burrows des quartiers de haute sécurité.
EPISODE 21
C'est le grand jour. Scofield se dévoile devant le directeur et le force à transférer Burrows à l'infirmerie. Bellick essaie désespérément de se libérer. Nick aussi dévoile son jeu : il travaille pour Abruzzi en échange de la liberté de son père : il doit apporter Veronica à l'aérodrome, comme garantie que Scofield donnera l'information Fibonacci à Abruzzi. Suite à de mauvais choix politiques, la Compagnie veut écarter la Vice-présidente, ce qui signifie qu'ils vont devoir la tuer. Le moment venu, la bande de Scofield se glisse, à huit, dans le trou de la cellule: Scofield, Sucre, Abruzzi, T-Bag, C-Note, Westmoreland, Tweener et Manche. Ils ont blanchi des vêtements pour se faire passer pour des prisonniers de l'aile psychiatrique. Ils courent le long des tunnels, trouvent Bellick qui s'était liberé, continuent jusqu'à l'aile psychiatrique, puis l'infirmerie où ils libèrent Burrows. Hayward (le disjoncté) les a rejoint, mais Westmoreland ne peut plus suivre à cause de sa blessure. Ils sont huit à traverser le câble jusqu'au mur extérieur au moment où l'alarme sonne.
EPISODE 22
Le groupe est hors de la prison, mais c'est la course entre eux et les gardes, avec à leur tête Bellick et Pope furieux. Plusieurs péripéties vont les ralentir, et même en faire tomber certain d'entre eux, dont une vengeance spéciale de la part d'Abruzzi envers T-Bag : comme il s'est menotté à Scofield, il lui coupe une main avec une hache.
Nick ayant décidé de ne pas livrer Veronica, doit faire face aux hommes d'Abruzzi. Veronica est sur la route de la maison du Montana où l'on sait que se cache Steadman vivant. Pope suspecte que c'est Sara qui a aidé Scofield. La Vice-Présidente confronte Mrs B : entre les deux ça sent l'échec et mat.
Nick ayant décidé de ne pas livrer Veronica, doit faire face aux hommes d'Abruzzi. Veronica est sur la route de la maison du Montana où l'on sait que se cache Steadman vivant. Pope suspecte que c'est Sara qui a aidé Scofield. La Vice-Présidente confronte Mrs B : entre les deux ça sent l'échec et mat.
